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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
“逛吃、逛吃”…… “列车集市”上“年货节”******
(新春走基层)“逛吃、逛吃”…… “列车集市”上“年货节”
中新网内蒙古大兴安岭1月18日电 题：“逛吃、逛吃”…… “列车集市”上“年货节”
作者 张玮 徐率
“您好！葡萄给我来一袋。”
“11元。”
“往前走一走，看一看有啥喜欢的！”
……
春节将至，为了让回家过年的人购买到物美价廉的年货，由加格达奇开往齐齐哈尔的4045次公益慢火车将年货集市搬上列车，沿途乡镇的家乡特产成为“列车大集”上的主角。
穿梭在大兴安岭林海的这趟公益慢火车上，别样年味儿扑面而来。
走进4045次列车的3号车厢，琳琅满目的年货吸引了人们的目光。
75岁的张华军老人家住白桦排，这里每天只通这一趟火车，每年过年他都要到邻村镇上的集市里购买年货，头一次赶上“列车大集”，他不由自主地在车厢逛了起来。
“列车大集”上设有生活物资区、土特产品区、网红零食区、民俗文化区、冻货区等，旅客可以在列车上购买瓜果蔬菜、米面粮油等生活物资，也可以买到木耳、蘑菇、榛子、蓝莓等地方特产，甚至还有对联、福字、灯笼等年货。
图为乘客在列车上赶大集。 王明月 摄李鹏是黑龙江省嫩江市伊拉哈镇伊拉哈中学的一名乡村支教老师，他与这趟列车有着很深的感情。当年，他坐着这辆公益慢火车走出山村求学。春节前夕，他又坐着这趟火车回到家乡支教。
“列车大集”的书籍区吸引了李鹏的目光。“身为教师，看到书就比较亲切，想着选一些适合初中生看的书籍带回学校，孩子们可以在课后看一看，丰富一下他们的情操。”
为了办好这次“列车大集”，列车组在3个月前就开始准备，征集民众对春运集市的需求，最后确定了6个品类的销售货品，其中大多数产品是沿途乡村的土特产，“列车大集”也成为家乡特产的展示平台。
4045次列车长何斌告诉记者，供货商也可以在列车上进行直播带货，打出自己的品牌，助力乡村振兴发展。
图为穿行在林海的公益慢火车。 王明月 摄这趟列车一路向北，跨过嫩江平原，穿越大兴安岭林海，全程431公里，单程运行9小时52分，沿途站停32站，其中，二道湾、青水山、团结、八方、白桦排等14个站每天只有这一趟列车经过。
何斌说：“现在我们各节车厢都是满员，车厢里每天都热闹极了。”
4045次列车至今已运行了40多年，这趟公益慢火车为偏远林区解决了出行难的问题，帮助沿线百姓在精准脱贫、乡村振兴的道路上迎着曙光一路前行。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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